Shin có bốn người con từ ba cuộc hôn nhân. Người vợ đầu tiên của ông là bà Noh Soon-hwa, mất năm 1951. Họ có một cô con gái là Shin Young-ja (sinh năm 1942).[10] Sau đó, Shin kết hôn với một phụ nữ người Nhật tên Hatsuko Shigemitsu vào năm 1952.[11] Họ có hai người con trai là Shin Dong-joo (sinh năm 1954)[12] và Shin Dong-bin (sinh năm 1955).[13] Shin cũng có một cuộc hôn nhân khác với một phụ nữ đồng hương là bà Seo Mi-kyung theo hệ thống luật hôn nhân thông thường của Hàn Quốc.[14] Họ có với nhau một người con gái là Shin Yu-mi (sinh năm 1983).[15]